格尔木市地区地表水资源丰富，仅大小河流有20多条。盆区的格尔木河年平均径流量7.796亿立方米，那棱格勒河年平均径流量10.3亿立方米；唐古拉山区河流年平均径流量合计48亿多立方米，总计近70亿立方米。地下水资源总量为29.73亿立方米，其中重复量为28.998亿立方米、可开采量为11.354亿立方米。盆区资源量为13.136亿立方米，其中重复量为12.704亿立方米。市区资源量为4.824亿立方米，其中重复量4.822亿立方米，可开采量为2.42亿立方米。含水层厚度约30—150米，地下水位在1—69米之间。盆地地下水来源主要是靠南昆仑山区的大气降水和冰雪融水，通过裂隙水或河流注入盆地进行补给。
